Ο κίνδυνος για την εμφάνιση της
HPV λοίμωξης αυξάνεται την περίοδο της σεξουαλικής ζωής. Η πλειονότητα των κρουσμάτων είναι στις ηλικίες 20-30 ετών. Υπολογίζεται ότι το 80% των γυναικών και το 50% των αντρών που έχουν σεξουαλικές σχέσεις θα προσβληθούν κάποια στιγμή στη ζωή τους από κάποιον από τους τύπους του ιού HPV. Μια HPV λοιμωξη μπορεί να μην προκαλέσει καμία αλλοίωση και ο οργανισμός να τον αποβάλλει μόνος του μέσα σε 2 χρόνια. Αυτό συμβαίνει και τις περισσότερες φορές άλλωστε που κάποιος είναι απλά φορέας και έχει μια HPV λοιμωξη.
Οι πιο συχνοί τύποι μιας HPV λοίμωξης είναι 4: οι 6 και 11 που ευθύνονται κατά 90% για τα κονδυλώματα και οι 16 και 18 που προκαλούν το 70% των καρκίνων του τραχήλου. Οι τύποι hpv λοίμωξης που έχει αποδειχθεί ότι είναι ογκογόνοι (υψηλού κινδύνου για εμφάνιση καρκίνου του τραχήλου της μήτρας) είναι οι 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 68, 73, 82 κ.ά. Οι διαπιστωμένοι μη ογκογόνοι είναι οι: 6, 11, 40, 42, 43, 44, 61, 70, 72, 81 κ.ά. Ωστόσο οι 6 και 11 σχετίζονται με το 10% των χαμηλού βαθμού αλλοιώσεων του τραχηλικού επιθηλίου, το πλακώδες καρκίνωμα του λάρυγγα και κάποιες σπάνιες μορφές όγκων (Buschke-Löwenstein) στο αιδοίο, το πέος και τον πρωκτό.
Τόσο τα κονδυλώματα που είναι καλοήθη όσο και οι προκαρκινικές αλλοιώσεις στον τράχηλο της μήτρας αντιμετωπίζονται με την κατάλληλη θεραπεία και μπορούν να υποστρέψουν. Γενικά η HPV λοίμωξη ακολουθεί την εξής πορεία: Τις περισσότερες φορές ο οργανισμός αυτοϊάται και αντιμετωπίζει την HPV λοιμωξη μόνος του. Συνήθως η HPV λοιμωξη είναι παροδική και το 1/3 των βλαβών χαμηλού κινδύνου υποχωρούν. Όμως η λοίμωξη μπορεί να εμμένει με αποτέλεσμα το άλλο 1/3 των βλαβών να παραμένουν σταθερές και οι υπόλοιπες να εξελίσσονται σε υψηλού βαθμού. Για να γίνει αυτή η εξέλιξη απαιτούνται συνήθως χρόνια.
Η πορεία που θα έχει η HPV λοιμωξη επηρεάζεται από τα γονίδια, το ανοσοποιητικό, το κάπνισμα και τη χρήση αντισυλληπτικών (επιβαρυντικός παράγοντας). Το συμπέρασμα είναι ότι για να έχουμε HPV λοιμωξη πρέπει απαραίτητα κάποιος να έχει μολυνθεί από τον ιό HPV, αλλά αυτό δεν οδηγεί απαραίτητα σε καρκίνο.