Οι αλλοιώσεις που προκαλεί ο ιός HPV εμφανίζονται σε διάφορα σημεία του πέους και χτυπούν και την υγεία του άντρα. Τα κονδυλωματα στον αντρα εμφανίζονται κυρίως στο πέος, το περίνεο, το όσχεο, τον πρωκτό και την ουρήθρα και η διάγνωση γίνεται με κλινική εξέταση και με τεστ πρωκτού (δείγμα όπως στο τεστ Παπ). Ο ιός HPV είναι εξίσου συχνός και προκαλεί κονδυλωματα σε γυναικες και άντρες και είναι επίσης επικίνδυνος. Οι υψηλού κινδύνου τύποι του που δεν σχετίζονται με τα κονδυλώματα (τις καλοήθεις βλάβες), μπορούν να προκαλέσουν καρκίνο του πέους και του πρωκτού.
Τα κονδυλώματα δεν εμφανίζονται σε όλους όσοι έχουν HPV, καθώς μια μεγάλη μερίδα παραμένουν φορείς και ασυμπτωματικοί. Μάλιστα, οι τύποι του ιού HPV που μπορούν να προκαλέσουν καρκίνο στους άντρες-και είναι διαφορετικοί από αυτούς που δημιουργούν κονδυλώματα- σπάνια προκαλούν συμπτώματα.
Γι’ αυτό το λόγο αν κάποιος άντρας εμφανίσει κονδυλώματα καλό είναι να απευθυνθεί άμεσα στο γιατρό για να ελεγχθεί και εκείνος και η σύντροφός του. Είναι πιθανό να έχει και άλλους τύπους που σχετίζονται με πιθανότητες εμφάνισης καρκίνου των γεννητικών οργάνων. Από εκεί και πέρα ο δερματολόγος θα αποφασίσει ανάλογα με την κλινική εικόνα με ποια μέθοδο θα αφαιρεθούν τα κονδυλωματα στον αντρα (στο πέος οι επιλογές είναι κυρίως λέιζερ ή καυτηριασμός που προσφέρουν πιο άμεσο αποτέλεσμα από την κρυοπηξία). Σε κάθε περίπτωση τα κονδυλωματα στον αντρα πρέπει να αφαιρεθούν γιατί μέσω των βλαβών μπορεί να μεταδοθεί πιο εύκολα ο ιός.